MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	CTG	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013972	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013972	TTG	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013972	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013972	GAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013972	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013972	CGG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013972	GAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013972	TCA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013972	GTTGAA	2	12	2311	2322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013972	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013972	A	6	6	3324	3329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013972	A	9	9	3332	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013972	CCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013972	ACA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013972	TC	3	6	3721	3726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013972	GCAG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013972	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013972	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013972	GCC	2	6	3880	3885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013972	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013972	AGG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013972	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013972	TAT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013972	ATT	3	9	5657	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013972	CTC	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013972	CGGT	2	8	7190	7197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013972	CGTTAA	2	12	7206	7217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013972	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013972	CCTG	2	8	7425	7432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013972	CCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013972	T	7	7	9196	9202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013972	TA	3	6	9213	9218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013972	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013972	GCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013972	AATA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013972	TC	3	6	14715	14720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013972	GGT	2	6	14761	14766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013972	AAT	2	6	14790	14795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013972	GCC	2	6	14807	14812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013972	CAA	2	6	14926	14931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013972	AGG	2	6	15666	15671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013972	TCAT	2	8	15970	15977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013972	CAG	2	6	16022	16027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013972	TCC	2	6	16097	16102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013972	GAT	2	6	16138	16143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013972	TGG	2	6	16152	16157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013972	TAT	2	6	16232	16237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013972	GT	3	6	16262	16267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013972	GAC	2	6	16290	16295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013972	ATA	2	6	16296	16301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013972	AAT	2	6	16548	16553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013972	TA	3	6	16590	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013972	TA	3	6	17281	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013972	TA	3	6	17305	17310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013972	AC	3	6	17346	17351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013972	TG	3	6	17395	17400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013972	ATGAGC	2	12	17402	17413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013972	A	8	8	17415	17422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013972	GCC	2	6	17451	17456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013972	CGT	2	6	17457	17462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013972	CGA	2	6	17466	17471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013972	GCT	2	6	17488	17493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013972	TGA	2	6	17508	17513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013972	C	10	10	17534	17543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_013972	TGG	2	6	18175	18180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013972	ATTTC	2	10	18200	18209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013972	TCA	2	6	18860	18865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013972	TGCC	2	8	18949	18956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013972	CAA	2	6	18983	18988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013972	TGT	2	6	18997	19002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013972	ATA	2	6	19021	19026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013972	AAT	2	6	19085	19090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013972	AT	3	6	19141	19146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013972	AATT	2	8	19149	19156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013972	GAA	2	6	19161	19166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013972	TGCCT	2	10	19845	19854	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013972	AGTGG	2	10	19871	19880	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013972	TAAA	2	8	19894	19901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013972	ATG	2	6	19966	19971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013972	ACCA	2	8	20023	20030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013972	GAA	2	6	20113	20118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013972	A	6	6	22163	22168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013972	AAG	2	6	22174	22179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013972	A	6	6	22180	22185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013972	GC	3	6	22205	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013972	CCG	2	6	22233	22238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013972	AGT	2	6	22278	22283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013972	T	8	8	22300	22307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013972	T	6	6	22309	22314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013972	TCC	2	6	22324	22329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013972	CGT	2	6	22337	22342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013972	AAG	2	6	22352	22357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013972	ATTG	2	8	22374	22381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013972	A	7	7	22393	22399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013972	TGT	2	6	22407	22412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013972	CTG	2	6	22441	22446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013972	CCAG	2	8	22486	22493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013972	CAG	2	6	22496	22501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013972	A	6	6	22536	22541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013972	AGA	3	9	24421	24429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013972	GAT	2	6	24503	24508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013972	AG	3	6	24537	24542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013972	CGG	2	6	24547	24552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013972	CCT	2	6	24607	24612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013972	AAAC	2	8	24676	24683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013972	AAT	2	6	24690	24695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013972	GAT	2	6	24737	24742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013972	CAG	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013972	A	7	7	24786	24792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013972	T	6	6	24795	24800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013972	A	6	6	24806	24811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013972	TAA	2	6	24816	24821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013972	TAT	2	6	24833	24838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013972	CAA	2	6	25082	25087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013972	A	8	8	25821	25828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013972	GAA	2	6	25859	25864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013972	C	6	6	25895	25900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_013972	TTA	2	6	25916	25921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013972	TGA	2	6	25961	25966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013972	CTTA	2	8	25973	25980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013972	CAA	2	6	25990	25995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013972	A	6	6	26172	26177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013972	ATT	2	6	26209	26214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013972	TACTGA	2	12	26215	26226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013972	CAA	2	6	26291	26296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013972	TCA	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013972	GCA	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013972	CAT	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013972	A	6	6	26480	26485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013972	GCGT	2	8	26496	26503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013972	ATG	3	9	26520	26528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013972	TGC	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013972	A	6	6	26659	26664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013972	TCGA	2	8	26740	26747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013972	TGCAG	2	10	26778	26787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013972	AATGAA	2	12	26898	26909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013972	A	6	6	26976	26981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013972	CCG	2	6	27010	27015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013972	T	7	7	27191	27197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013972	CTTTTA	2	12	27209	27220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_013972	TAT	2	6	27231	27236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013972	TAA	2	6	27237	27242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013972	GA	3	6	27268	27273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013972	GA	3	6	27312	27317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013972	T	7	7	27337	27343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013972	CT	3	6	27402	27407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013972	C	6	6	27433	27438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_013972	CAT	2	6	27503	27508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013972	TACT	2	8	27525	27532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013972	CAT	2	6	27573	27578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013972	AGTTA	2	10	27586	27595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013972	GAA	2	6	27620	27625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013972	CAT	2	6	27637	27642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013972	AAT	2	6	27663	27668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013972	A	6	6	27710	27715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013972	T	6	6	27720	27725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013972	GA	3	6	27767	27772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013972	ATG	2	6	27774	27779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013972	GGA	2	6	27818	27823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013972	AGG	2	6	27836	27841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013972	T	6	6	28120	28125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013972	GTT	2	6	28172	28177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013972	CCTG	2	8	28198	28205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_013972	TG	3	6	28211	28216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013972	AAT	2	6	28218	28223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.